O minhocário da Escola é um espaço localizado próximo à horta e que também fornece material para ser fonte de pesquisa. Em 2003, as turmas de 8ª série se engajaram numa pesquisa com o objetivo de controlar e otimizar a produção de húmus em pequeno porte. Para isso, os envolvidos calcularam desde a quantidade de esterco que alimentava as minhocas até a quantidade de húmus na produção final. O húmus produzido é usado como fertilizante da própria horta da Escola.